生母可以选择不参与鉴定。亲子鉴定中，孩子及假设父亲的标本通常足以得知结果，母亲可以选择不参与鉴定。亲生母亲也检测，结论更准确。因为孩子的基因一个来自母亲一个来自父亲。若有生母做参考（即双亲鉴定），可以根据母亲和孩子的基因型，比较明确推导出生父的基因，从而与争议父（即您）作比较。若没有母亲，则直接根据孩子基因推导生父基因，这样可能的情况有很多，最终统计学得出的数值偏差相对大点。
实际上，我们普遍使用的检测15个STR基因座的结果进行过计算机模拟单亲案例，两个无血缘关系的人，用这一的检测系统，至少有3个违反遗传法则，99.99%的非父亲可以排除，但有1/1000的可能无法排除而错误认定。因此我们对于单亲鉴定，跟其他机构不同之处是另外还增加一个试剂盒，增加9个检测指标，这样更准确，尽可能避免出现偏差。这也是单亲鉴定收费要高于生母参与鉴定的原因。
