蒸南瓜虽然美味但是也有一些食用禁忌要注意。
在搭配方面，南瓜与醋相克这是由于同食的话，醋含有的醋酸会破坏南瓜的营养成分；再者南瓜不能与螃蟹、鲤鱼同食，否者会引起呕吐、眩晕和腹痛、腹泻等食物中毒现象；由于南瓜还有一定量的维生素C分解酶，这也就使得南瓜不宜与含维生素C丰富的蔬菜一起搭配，比如红枣、番茄、菠菜、白菜、、油菜、椰菜等等，但是南瓜含有的维生素C分解酶在高温下会失活，所以南瓜最好是蒸熟吃避免破坏其他食物的营养素；《本草纲目》记载：“南瓜不可与羊肉同食，令人气壅。”南瓜补中益气与羊肉的大热补虚相克同食则令人肠胃气壅，所以要避免与羊肉同食；还有一点虾也是不能和南瓜搭配的，一起食用会造成痢疾，万一误食，可以用黑豆和甘草来解毒。
一般来说南瓜适宜大众食用，特别适合老年人、糖尿病患者、肥胖人群和便秘患者，胃病患者也可以适量食用，但是每次最好不要超过200克的量。但是由于南瓜性温，胃热炽盛者、气滞中满者、湿热气滞者要少吃，患有脚气、黄疸、气滞湿阻病者也是要避免食用南瓜。
