11月1日,北京市农林科学院蔬菜中心许勇团队联合国内外多家科研机构在《天然 遗传学》(Nature Genetics)在线宣布文章,完结了新一代西瓜基因组精密图谱制作和驯化前史解析,初次系统提醒了西瓜果实质量性状进化的分子机制。这是继2013年完结世界首张西瓜基因组序列图谱后,许勇团队的又一次严重突破性效果,奠定了我国在西瓜基因组学与分子育种技能研讨范畴的国际领先地位。
许勇
许勇在文章宣布后榜首时间在朋友圈共享喜讯,感谢一路斗争的团队与合作者。将这次学术效果称为“富丽回身的礼炮”、“种类立异的利器”“顶天立地的梵文”“不忘初心的号角”。他说,技能引领换代种类的辈出,演绎了高技能真实精华,谱写了大地上更为精彩的华章。
该研讨选用单分子测序、光学图谱与Hi-C三维基因组联合剖析战略,完结了全新一代西瓜基因组高质量精密图谱制作,基因组拼装巨细365 Mb,N50提高到21.9Mb,是迄今为止最高质量的西瓜基因组序列图谱。
文章截图
在此基础上,对掩盖世界上现存的西瓜属悉数7个种的414份代表性西瓜种质资源展开了基因组变异剖析,在基因组水平上证明了非洲苏丹区域西瓜资源与高糖培养西瓜的先人遗传联系最近,并发现黏籽西瓜(C. mucosospermus)是距现代培养西瓜(C. lanatus)亲缘联系最近的种群且具有一起的先人。基因漂移等依据标明饲用西瓜(C. amarus)与这两个种群之间或许存在独立进化,初次从全基因组层面清晰了西瓜7个种之间的进化联系。
瓜物种与质量性状进化分子机制形式图。
经过进化和驯化剖析,系统解析了野生西瓜到培养西瓜的驯化前史,判定获得了果实巨细、果肉含糖量、苦味等重要质量性状的候选基因,并对α-半乳糖苷酶基因ClAGA2等重要基因进行了功用验证。研讨还发现了人类使用野生西瓜种质进行抗性改进的基因组进入痕迹,提醒了人类及动物活动在西瓜质量构成进化中的重要作用,为西瓜功用基因深入研讨及优异基因资源的使用供给了重要数据支撑和理论基础,具有重要实践含义和科学价值。
北京市农林科学院郭绍贵和孙宏贺、中国农科院赵胜杰和林涛、美国康奈尔大学王昕和吴珊为论文一起榜首作者。许勇研讨员、刘文革研讨员、费章君教授和黄三文研讨员为一起通讯作者。本研讨遭到国家天然科学基金要点项目、国家七大作物育种要点研制方案、北京学者、西甜瓜工业技能系统等项目赞助。